Ситуацию прокомментировала ФНС у себя на сайте.

Налоговики напомнили, что договор ДМС заключается отдельно по каждому работнику. При этом платежи по таким договорам, заключенным на срок не менее года, не облагаются страховыми взносами.

Если же получилось так, что работник уволился и ДМС расторгли досрочно, то срок действия договора может оказаться менее года. В этом случае работодатель должен доначислить страховые взносы на платежи по такому договору, включая платежи, осуществленные в предыдущем расчетном периоде (если даты начала и окончания действия ДМС находятся в разных периодах). Также следует подать уточненные РСВ для соблюдения пенсионных прав уволенного работника.